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更新時間：2024-10-23
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太忙，許久沒有寫什么東西。也很少能找到時間靜下心來去思考一些事情。大環境太卷，都不知道在卷什么。
即便忙到飛起，還是有很多時間很可惜的浪費掉了。解析結構也是如此。有時忙活半天才發現，起初的結論壓根就是個“苦笑”的錯誤。
從電報烏龍看科學解析的局限
培訓時，突然想起初中時一件啼笑皆非的事情。在那個還幾乎沒有電話的年代，依稀記得初二那年，語文老師突然接到東北老家發來的電報，意思是父親病故速回。語文老師哭紅了眼睛跟我們說她回去幾天。然而一個禮拜之后語文課上，她十分氣憤地告訴我們這是一個大烏龍，譯報員翻譯錯了電報信息......。具體是什么，已不記得。但是譯報員的工作和我們解析結構其實并沒有什么區別。
人眼睛是有局限的，只能看到晶體的外形。衍射儀也是有局限的，只能給你晶體的衍射空間數據。我們想要的結構是要靠程序和電腦去從衍射數據里挖掘的。既然沒有直接看見，意思如同一個老師講的那樣“所見非所得”，我們只是在靠科學的手段去猜罷了。如同在破譯電報，破譯錯了很多時候也看起來像那么回事。所以數據庫里或者文章里的很多結構不見得就是對的。
常見的結構解析錯誤
比較常見的結構解析錯誤，包括晶胞定錯，晶系定錯以及空間群定錯，當然還有模型的搭建錯誤等等。而空間群定錯基本上十分的隱蔽，即便是從業多年的晶體民工，也很難分清一些細小的差別。記錄下錯誤也許下次才不會再犯。
這個晶體呢，確實有難度而且衍射很弱。XPREP給出的空間群是P2221。
然而P2221解析不出結構。嘗試了許久才終于在P212121下得到了原料組成的框架。并且精修下來還不算太差。更有趣的是，結構連接成了COF的框架結構。雖然數據分析并不支持P212121的空間群，但也許會有孿晶的原因，且這是只能拿到的結果?？吹竭@樣的結果其實是有些興奮的，這樣連接成的COF結構屬于出乎意料的結果，是個“新的發現”。
然而這樣的結果，并不能讓人放心，太多的反常。比如堆積十分的緊密，原子間的間距太近。有些透不過來氣的感覺。這樣看起來像那么回事的結構真的存在么？還好，這樣的懷疑保持到了結束。其它的實驗表征也不支持這是一個COF晶體。也就是需要推導了重來。仔細分析空間群可能的結構，以及衍射圖上的系統消光規律，其實可以推導出空間群有可能的是P21212，而不是P212121。有了合理的分析后，結構解析也就可以在確定的方向上不斷努力，而不是到處亂猜。結果得到了更合理的結果，甚至溶劑也都可以看到了。
結論
所以剛開始看到的有趣的結構，被一系列的反常所打破。因為空間群定錯的原因，我們破譯錯了衍射信息，自然也就得到了錯誤的結構。即便精修的參數看起來并不是那么差，但也不過是假象罷了。
如果這樣的結構發表了，也真就變成了笑話了。切記仔細小心！
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