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更新時間：2020-08-06
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新一代的D8QUEST/VENTURE配備了更強的光源，更靈敏，更大的探測器，讓我們能夠更高效地收集更高分辨率的數(shù)據(jù)。晶體數(shù)據(jù)分辨率的提高，讓我們能夠更清晰地看到原子世界的奧秘，比如成鍵電子，孤對電子等。
然而50多年來，我們使用的結構精修方法，采用的是獨立原子模型（Independent Atom Model, IAM），無法完美地描述真實的電子云形狀。因而對于高分辨率的數(shù)據(jù)，IAM結構精修方法反而會導致更高的R1值。為此，很多時候為了發(fā)表文章，或者迎合checkcif，我們只好忍痛去截斷分辨率，白白浪費了很多非常有意義的數(shù)據(jù)。
而現(xiàn)在，Bruker新的APEX3軟件開發(fā)了IDEAL結構精修方法，在IAM的結構精修的基礎上，可以將成鍵電子以及孤對電子的貢獻加入到結構模型之中，從而獲得更真實，更佳質量的晶體結構。
▲Fig.1 IAM 結構模型下的殘余電子密度
獨立原子模型（IAM） VS 多極結構模型（MM）
獨立原子模型
原子被認為相互之間是獨立的
原子的位置以及位移參數(shù)僅能夠計算正確晶格位置的原子類型以及占有率
IAM沒有考慮到原子間的區(qū)域
IAM沒有描述成鍵，孤對電子，電荷，電荷轉移的效應
多極模型
MM方法模擬了原子間區(qū)域，重要的特征：化學鍵
它將總電荷密度分配給球諧函數(shù)，即所謂的多極
比如原子間向量上的偶極子可以解釋鍵電荷密度
▲Fig.2 IAM VS MM
APEX3-IDEAL，更好的結構精修方法
為了更好地精修高分辨率的數(shù)據(jù)，新的APEX3軟件，開發(fā)了更完美的結構精修方法IDEAL(Invariom Derived Electron AnaLysis)。簡潔，智能的軟件界面，讓我們能夠更好地修正高分辨率的數(shù)據(jù)，從而獲得更精細的結構信息。APEX3*的XL程序可以直接調用IDEAL，精修結果和Checkcif*兼容。
▲ APEX3 Refinement
IDEAL結構精修舉例
▲Fig.4 Examples of IDEAL Refinement Results
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